Le nom de la commune a pour origine De Mauritania, nom d'un légionnaire romain des troupes de J. César et originaire d’Afrique du Nord.

Le village se développe autour du château des seigneurs de Tournai. En 1214, avant la bataille de Bouvines, le comte de Flandre et l’empereur Othon se rassemblent à Mortagne-du-Nord. Passé à la France en 1313, le village est plusieurs fois offert par les rois de France en tant que récompense. En 1490, l’hôpital Touars est créé. Pris en 1793 au cours des hostilités entre Français et Autrichiens, le château est détruit en 1918.

Parmi les activités économiques dont vivait Mortagne-du-Nord se trouvent la bonneterie, l’exploitation d’argile, la poterie et la construction de bateaux.

C'est à Mortagne-du-Nord que se situe la zone de confluence de deux voies d'eau d'importance : l'Escaut (entre Valenciennes et Mortagne) et la Scarpe (entre Douai et Mortagne). La commune y possède un port fluvial.

Mortagne compte aujourd'hui plus de 1600 habitants.